sqlite3 に不具合があったのでしょうか？再び ports へ sqlite3 のアップデートが入っていました。
その他のアップデートと一緒に portupgrade で処理しました。
p5-BerkeleyDB-0.41 < needs updating (port has 0.42)
p5-HTML-Parser-3.66 < needs updating (port has 3.67)
sqlite3-3.6.23.1_2 < needs updating (port has 3.6.23.1_3)
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